{"id":7504,"date":"2020-02-20T16:02:58","date_gmt":"2020-02-20T19:02:58","guid":{"rendered":"http:\/\/tdibrasil.org\/?p=7504"},"modified":"2020-02-20T16:02:58","modified_gmt":"2020-02-20T19:02:58","slug":"seriam-os-sitios-ativos-estruturas-de-complexidade-irredutivel","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/tdibrasil.org\/index.php\/2020\/02\/20\/seriam-os-sitios-ativos-estruturas-de-complexidade-irredutivel\/","title":{"rendered":"Seriam os S\u00edtios Ativos Estruturas de Complexidade Irredut\u00edvel?"},"content":{"rendered":"
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S\u00edtio catal\u00edtico \/ Thomas Shafee \u00a9<\/a><\/center><\/figcaption><\/figure>\n
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Ol\u00e1, Eskelsen! Eu tenho uma d\u00favida com rela\u00e7\u00e3o a prote\u00ednas em um dos argumentos que usamos. A TDI tem um forte pilar que \u00e9 mostrar que a evolu\u00e7\u00e3o darwiniana n\u00e3o pode gerar novidade biol\u00f3gica (1)<\/strong>, pois n\u00e3o pode gerar novas prote\u00ednas funcionais (novas fun\u00e7\u00f5es). Isso porque a fun\u00e7\u00e3o de uma prote\u00edna est\u00e1 ligada ao seu s\u00edtio b\u00e1sico, e essas estruturas al\u00e9m de rar\u00edssimas, como a mostrada por Douglas Axe na ordem de uma em 10^77<\/a> (2)<\/strong>, o s\u00edtio b\u00e1sico n\u00e3o funciona sem estar completo.<\/p>\n

At\u00e9 ai entendi perfeitamente.<\/p>\n

Sei que uma prote\u00edna tamb\u00e9m pode sofrer adi\u00e7\u00e3o de amino\u00e1cidos mas a fun\u00e7\u00e3o b\u00e1sica permanece a mesma. Por\u00e9m o evolucionista n\u00e3o poderia dizer que essas adi\u00e7\u00f5es gradativas em um s\u00edtio b\u00e1sico fizeram com que ao longo do tempo um novo s\u00edtio b\u00e1sico surgisse? (3)<\/strong><\/p>\n

Obs: Sei tamb\u00e9m que essa obje\u00e7\u00e3o s\u00f3 faz sentido se os s\u00edtios b\u00e1sicos de prote\u00ednas pudessem ser reduzidos a outros s\u00edtios com outra fun\u00e7\u00e3o. Porque se os s\u00edtios b\u00e1sicos s\u00e3o estruturas singulares, onde ao tirar amino\u00e1cidos n\u00e3o se chega a outros s\u00edtios mais simples, o evolucionista n\u00e3o teria para onde correr, pois n\u00e3o existe passo intermedi\u00e1rio (4)<\/strong>.<\/p>\n

Se puder tirar essa d\u00favida vai ajudar muito.<\/p>\n

David Balla<\/strong><\/p>\n

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Segundo a defini\u00e7\u00e3o de complexidade irredut\u00edvel, \u00e9 poss\u00edvel que v\u00e1rias enzimas tenham realmente algum grau de complexidade irredut\u00edvel.<\/p>\n

O processo evolutivo assegura que as estruturas biol\u00f3gicas possam ser formadas lenta e gradualmente por sucessivas mudan\u00e7as que garantam alguma vantagem. Estruturas aparentemente simples como s\u00edtios ativos n\u00e3o est\u00e3o inclusas na argumenta\u00e7\u00e3o do design por complexidade irredut\u00edvel, mas s\u00e3o considerados design em muitos casos por mera improbabilidade.<\/p>\n

Os s\u00edtios ativos s\u00e3o regi\u00f5es nas enzimas que favorecem rea\u00e7\u00f5es qu\u00edmicas. Nem toda prote\u00edna \u00e9 uma enzima, mas algumas possuem o s\u00edtio ativo como uma ferramenta para trabalhar sobre outras mol\u00e9culas (substratos). E esse s\u00edtio ativo permite essa atividade enzim\u00e1tica, que \u00e9 promover alguma rea\u00e7\u00e3o qu\u00edmica.<\/p>\n

S\u00edtios Ativos: quando prote\u00ednas s\u00e3o enzimas<\/strong><\/p>\n

Os organismos precisam manter suas estruturas biol\u00f3gicas e as enzimas trabalham nisso sem cessar. Elas comp\u00f5e o que chamamos “metabolismo”. Elas tecem desde as unhas at\u00e9 os fios de cabelo, a pele, os tecidos em geral, fazem reparos; participam ativamente dos sentidos: transformam est\u00edmulos em sinais para que se possa ver, sentir sabores, ouvir etc. e etc. Praticamente para cada necessidade biol\u00f3gica h\u00e1 no m\u00ednimo uma prote\u00edna relacionada (quando n\u00e3o milhares).<\/p>\n

O s\u00edtio ativo possui ainda internamente um s\u00edtio de liga\u00e7\u00e3o, para o encaixe, e o s\u00edtio catal\u00edtico, onde a atividade enzim\u00e1tica ocorre:<\/p>\n

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Estrutura da Prote\u00edna (Enzima) \/ Thomas Shafee \u00a9<\/a><\/center><\/figcaption><\/figure>\n

Como voc\u00ea pode ver, o s\u00edtio catal\u00edtico depende da conforma\u00e7\u00e3o do s\u00edtio de liga\u00e7\u00e3o e este da conforma\u00e7\u00e3o do s\u00edtio ativo, todos eles ainda dependem da estrutura tridimensional da prote\u00edna.<\/p>\n

Cofator: a ferramenta para as atividades<\/strong><\/p>\n

Ainda h\u00e1 outro elemento crucial nas enzimas, o cofator. Subst\u00e2ncias inorg\u00e2nicas necess\u00e1rias para atividade enzim\u00e1tica. \u00cdons de metais como c\u00e1lcio, zinco, pot\u00e1ssio, s\u00f3dio, mangan\u00eas, magn\u00e9sio, cobre e ferro s\u00e3o ajustados no s\u00edtio catal\u00edtico para acelerar as rea\u00e7\u00f5es. Algumas rea\u00e7\u00f5es levariam at\u00e9 milh\u00f5es de anos para acontecer, outras poderiam mesmo tomar bilh\u00f5es de anos<\/a>. As enzimas fazem essa rea\u00e7\u00e3o acontecer em milissegundos.<\/p>\n

Na perspectiva evolutiva, fen\u00f4menos como a promiscuidade enzim\u00e1tica combinada com duplica\u00e7\u00e3o de genes<\/a> tentam explicar a origem das enzimas. A promiscuidade enzim\u00e1tica \u00e9 a capacidade de uma enzima catalisar outras rea\u00e7\u00f5es al\u00e9m de sua rea\u00e7\u00e3o principal. Creio que o caso emblem\u00e1tico da nylonase<\/a> ilustre bem isso, mas no fim \u00e9 um exemplo modesto que n\u00e3o d\u00e1 o suporte a narrativa evolutiva para a diversidade biol\u00f3gica.<\/p>\n

Respondendo aos pontos<\/strong><\/p>\n

1. Sobre “a evolu\u00e7\u00e3o darwiniana n\u00e3o pode gerar novidade biol\u00f3gica”. Na verdade, n\u00e3o \u00e9 uma impossibilidade absoluta, mas uma grande improbabilidade que reduz totalmente a plausibilidade. \u00c9 algo desfavorecido que inviabiliza toda a hist\u00f3ria evolutiva proposta. A evolu\u00e7\u00e3o darwiniana \u00e9 muito pobre em gerar novidade biol\u00f3gica de forma que as perdas superam qualquer ganho. A tend\u00eancia \u00e9 o decl\u00ednio dos sistemas biol\u00f3gicos, o que refuta as pretens\u00f5es darwinianas. Behe fez um vasto trabalho para averiguar at\u00e9 onde o darwinismo pode ir e conseguiu alguns raros exemplos limite que deram os contornos a sua hip\u00f3tese:<\/p>\n

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Um exemplo de um verdadeiro ganho de FCT por duplica\u00e7\u00e3o citado em minha publica\u00e7\u00e3o foi o trabalho de Olsthoorn e van Duin (1996), onde a duplica\u00e7\u00e3o de 14 nucleot\u00eddeos levou \u00e0 forma\u00e7\u00e3o de novos elementos codificados funcionais (n\u00e3o simplesmente repetindo elementos preexistentes), por isso n\u00e3o \u00e9 simplesmente uma muta\u00e7\u00e3o de modifica\u00e7\u00e3o-de-fun\u00e7\u00e3o.<\/p>\n

Michael Behe. \u00d3culos com lentes cor-de-rosa: Lenski, citrato e a BioLogos<\/a>.<\/p><\/blockquote>\n

2. A raridade de uma em 10^77 de Axe<\/a> \u00e9 sobre a dobra da estrutura tridimensional. O s\u00edtio ativo ainda ser\u00e1 um \u00ednfima fra\u00e7\u00e3o dentro desse n\u00famero, porque o s\u00edtio depende criticamente da estrutura tridimensional. Esse n\u00famero \u00e9 ainda desconhecido.<\/p>\n

3. N\u00e3o sei dizer ao certo quais casos um s\u00edtio ativo pode ser tornar outro atrav\u00e9s de sele\u00e7\u00e3o, mas sabemos que isso n\u00e3o elimina de fato a complexidade irredut\u00edvel da estrutura. Um caso de refuta\u00e7\u00e3o seria uma prote\u00edna sem s\u00edtio ativo que desenvolvesse essa estrutura, e isso se aplicaria para o caso espec\u00edfico a princ\u00edpio sem ser generalizado.<\/p>\n

4. Essa redu\u00e7\u00e3o para estruturas mais simples \u00e9 um problema evolutivo grave. Eles realmente n\u00e3o conseguem nada persuasivo. Afirmar que complexidade irredut\u00edvel n\u00e3o existe e sofrer frustra\u00e7\u00f5es desde a d\u00e9cada de 1970 tentando reduzir essas estruturas deve ser algo singular na hist\u00f3ria da ci\u00eancia.<\/p>\n

Ilhas Funcionais<\/strong><\/p>\n

Algumas fun\u00e7\u00f5es est\u00e3o pr\u00f3ximas no espa\u00e7o de possibilidades, a minoria. Ent\u00e3o a mudan\u00e7a de uma fun\u00e7\u00e3o para outra, que n\u00e3o refuta a complexidade irredut\u00edvel, n\u00e3o \u00e9 algo dominante. Pelo contr\u00e1rio, as funcionalidades est\u00e3o longe uma das outras, em “ilhas funcionais”<\/a>. Isso significa que a passagem gradual de uma configura\u00e7\u00e3o para outra \u00e9 implaus\u00edvel.<\/p>\n

Texto Relacionado:<\/strong><\/p>\n