{"id":4849,"date":"2018-12-10T10:48:45","date_gmt":"2018-12-10T12:48:45","guid":{"rendered":"http:\/\/tdibrasil.org\/?p=4849"},"modified":"2021-10-10T12:13:50","modified_gmt":"2021-10-10T15:13:50","slug":"revisitando-uma-antiga-questao-retrovirus-e-ancestralidade-comum","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/tdibrasil.org\/index.php\/2018\/12\/10\/revisitando-uma-antiga-questao-retrovirus-e-ancestralidade-comum\/","title":{"rendered":"Revisitando uma Antiga Quest\u00e3o: Retrov\u00edrus e Ancestralidade Comum"},"content":{"rendered":"<figure id=\"attachment_4858\" aria-describedby=\"caption-attachment-4858\" style=\"width: 580px\" class=\"wp-caption aligncenter\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" src=\"https:\/\/tdibrasil.org\/wp-content\/uploads\/2018\/12\/retrovirus.jpg\" alt=\"\" width=\"580\" height=\"460\" class=\"size-full wp-image-4858\" \/><figcaption id=\"caption-attachment-4858\" class=\"wp-caption-text\"><center>Ilustra\u00e7\u00e3o simplificada de um retrov\u00edrus.<\/center><\/figcaption><\/figure>\n<hr \/>\n<p>Por <strong>Jonathan M.<\/strong> <em>(Adapta\u00e7\u00e3o)<\/em><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Um argumento comum para descend\u00eancia comum que se ouve com muita frequ\u00eancia na literatura evolucion\u00e1ria diz respeito \u00e0 inser\u00e7\u00e3o de retrov\u00edrus end\u00f3genos (ERVs) em <em>loci<\/em> ort\u00f3logos (mesmo local) em genomas de primatas.\u00a0De longe, a apresenta\u00e7\u00e3o mais clara e sucinta da vers\u00e3o mais forte deste argumento que encontrei pode ser encontrada\u00a0<a href=\"https:\/\/www.evolutionarymodel.com\/ervs.htm\">neste artigo de Internet de n\u00edvel popular<\/a>.\u00a0O artigo estabelece tr\u00eas camadas de evid\u00eancias, baseadas em elementos do ERV, que servem para confirmar o modelo evolutivo de ancestralidade comum.\u00a0Segundo o artigo, essas camadas de evid\u00eancia s\u00e3o:<\/p>\n<blockquote>\n<p style=\"text-align: justify;\">1. A presen\u00e7a de ERVs em <em>loci<\/em> ort\u00f3logos entre esp\u00e9cies de v\u00e1rios graus de separa\u00e7\u00e3o taxon\u00f4mica e das hierarquias aninhadas abarcadas.<br \/>\n2. Os graus comparativos de descontinuidade em repeti\u00e7\u00f5es terminais longas (LTR-LTR) entre ERVs ort\u00f3logos completos.<br \/>\n3. Muta\u00e7\u00f5es compartilhadas entre ERVs ort\u00f3logos e as hierarquias aninhadas abarcadas.<\/p>\n<\/blockquote>\n<p style=\"text-align: justify;\">Eu quero tomar algum tempo para examinar essas tr\u00eas camadas de evid\u00eancia em uma s\u00e9rie de tr\u00eas posts no blog.\u00a0Mas, primeiro, vamos dar um passo para tr\u00e1s e explorar alguns antecedentes.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Como consequ\u00eancia da <strong>a\u00e7\u00e3o de prote\u00ednas de repara\u00e7\u00e3o do DNA<\/strong> na c\u00e9lula hospedeira de intervalos de cadeia simples, <strong>em cada extremidade da sequ\u00eancia <\/strong>formada ap\u00f3s a inser\u00e7\u00e3o do elemento, uma integra\u00e7\u00e3o \u00e9 marcada e caracterizada por uma <strong>duplica\u00e7\u00e3o do s\u00edtio alvo<\/strong>.\u00a0\u00c9 assim que estabelecemos que essas sequ\u00eancias\u00a0s\u00e3o, de fato, inser\u00e7\u00f5es.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">\u00c9 claro que, para uma inser\u00e7\u00e3o de ERV ser perpetuada pela descend\u00eancia, o retrov\u00edrus deve infectar as c\u00e9lulas germinativas.\u00a0E, de fato, foi documentado que\u00a0<a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC1805449\/pdf\/1742-4690-4-7.pdf\">a linha germinativa \u00e9 um alvo<\/a>\u00a0para o retrov\u00edrus SIV e SHIV em macacos jovens.\u00a0Al\u00e9m disso, esses elementos certamente se parecem notavelmente com elementos retrovirais.\u00a0Por exemplo, eles possuem tr\u00eas genes marcadamente retrovirais chamados\u00a0<em>gag<\/em>,\u00a0<em>pol<\/em>\u00a0e\u00a0<em>env\u00a0<\/em>(que codificam prote\u00ednas virais incluindo a matriz viral, c\u00e1pside, nucleoprote\u00ednas, transcriptase reversa, integrase e a prote\u00edna do envelope).<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Alguns proponentes da DI argumentaram que, apesar dessa apar\u00eancia impressionante, a estrutura do sistema de produ\u00e7\u00e3o de c\u00e9lulas germinativas torna extremamente improv\u00e1vel que as inser\u00e7\u00f5es fossem realizadas por v\u00edrus e, assim, essas sequ\u00eancias at\u00e9 agora consideradas ERV na verdade n\u00e3o de origem viral em geral.\u00a0Este \u00e9 um argumento interessante.\u00a0Ele\u00a0<em>faz p<\/em>arecer pouco prov\u00e1vel que elementos retrovirais possam se inserir literalmente centenas de milhares de vezes nas c\u00e9lulas germinativas sem causar danos fatalistas ao organismo hospedeiro.\u00a0Al\u00e9m disso, parece muito mais prov\u00e1vel um espermatozoide\u00a0viralmente infectado ser substancialmente menos apto e, portanto, superado na corrida para a fecunda\u00e7\u00e3o.\u00a0E o processo de apoptose (morte celular programada) provavelmente eliminaria as c\u00e9lulas sexuais infectadas por v\u00edrus.\u00a0Embora uma inser\u00e7\u00e3o germinativa t\u00e3o bem sucedida possa ser herdada em circunst\u00e2ncias muito raras, sua ocorr\u00eancia literalmente centenas de milhares de vezes parece altamente improv\u00e1vel.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Na \u00faltima d\u00e9cada ou duas, v\u00e1rias fun\u00e7\u00f5es diferentes foram identificadas para os componentes dos ERVs.\u00a0Por exemplo, sabe-se que as repeti\u00e7\u00f5es terminais longas (LTRs), que ocorrem nas extremidades 5&#8242; e 3&#8242; da sequ\u00eancia retroviral, servem como promotores nos organismos (Dunn\u00a0<em>et al.<\/em>\u00a0, 2005).\u00a0<a href=\"https:\/\/bioinformatics.oxfordjournals.org\/content\/24\/14\/1563.full.pdf\">Conley\u00a0<em>et al.\u00a0<\/em>(2008)<\/a>\u00a0tamb\u00e9m relatam que:<\/p>\n<blockquote>\n<p style=\"text-align: justify;\">Nossa an\u00e1lise revelou que as sequ\u00eancias retrovirais no genoma humano codificam dezenas de milhares de promotores ativos;\u00a0<strong>as sequ\u00eancias de ERV transcritas correspondem a 1,16% da sequ\u00eancia do genoma humano<\/strong> e os marcadores PET que capturam <strong>os transcritos iniciados a partir de ERVs cobrem 22,4% do genoma.<\/strong>\u00a0Esses dados sugerem que os ERVs podem regular a transcri\u00e7\u00e3o humana em larga escala.<\/p>\n<\/blockquote>\n<p style=\"text-align: justify;\">De fato, as LTRs do ERV ajudaram at\u00e9 mesmo a moldar a prote\u00edna supressora de tumor, p53 (tamb\u00e9m conhecida como \u201cguardi\u00e3 do genoma\u201d), conforme documentado por\u00a0<a href=\"https:\/\/www.pnas.org\/content\/104\/47\/18613.full\">Wang\u00a0<em>et al.\u00a0<\/em>(2007)<\/a>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pubmed\/12533431\">Kigami\u00a0<em>et al.\u00a0<\/em>(2003)<\/a>\u00a0tamb\u00e9m relatam que o MuERV-L \u00e9 um dos primeiros genes transcritos em embri\u00f5es de uma c\u00e9lula de camundongo.\u00a0De fato, derrubar a express\u00e3o dessa sequ\u00eancia faz com que a embriog\u00eanese pare no est\u00e1gio de quatro c\u00e9lulas.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">H\u00e1 tamb\u00e9m agora uma riqueza crescente de literatura que documenta o papel dos ERVs em conferir imunidade ao hospedeiro contra a infec\u00e7\u00e3o por retrov\u00edrus ex\u00f3genos (ver, por exemplo,\u00a0<a href=\"http:\/\/www.plosgenetics.org\/article\/info:doi\/10.1371\/journal.pgen.0010044\">Malik e Henikoff, 2005<\/a>).<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Uma incid\u00eancia particularmente not\u00e1vel de funcionalidade em rela\u00e7\u00e3o a estas sequ\u00eancias \u00e9 o envolvimento das prote\u00ednas do envelope retroviral altamente fusog\u00eanicas (as sincicinas) que s\u00e3o conhecidas por estarem crucialmente envolvidas na forma\u00e7\u00e3o da camada de sincitiotrofoblastos da placenta, gerada pela fus\u00e3o de c\u00e9lulas de trofoblasto.\u00a0Estas prote\u00ednas s\u00e3o absolutamente cr\u00edticas para o desenvolvimento placent\u00e1rio em humanos e camundongos.\u00a0Os diferentes tipos de prote\u00edna Syncytin s\u00e3o chamados de \u201csincicina A\u201d e \u201csincicina B\u201d (encontrados em camundongos);\u00a0\u201cSyncytin-1\u201d e \u201csyncytin-2\u201d (encontrado em humanos).\u00a0Mas aqui est\u00e1 a coisa not\u00e1vel: apesar de servir exatamente a mesma fun\u00e7\u00e3o, syncytin-A e syncytin-B n\u00e3o est\u00e3o relacionados a syncytin-1 e syncytin-2.\u00a0A prote\u00edna sincicina tamb\u00e9m desempenha a mesma fun\u00e7\u00e3o em coelhos (sincicina-ory1).\u00a0Mas a sincicina de coelho n\u00e3o est\u00e1 relacionada nem ao rato nem \u00e0 forma humana.\u00a0Esses ERVs nem est\u00e3o no mesmo cromossomo.\u00a0A sincytin-1 est\u00e1 no cromossomo 7;\u00a0a sincicina-2 est\u00e1 no cromossomo 6;\u00a0a sincicina A est\u00e1 no cromossoma 5;\u00a0e a sincicina-B est\u00e1 no cromossomo 14.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">De fato,\u00a0<a href=\"https:\/\/www.pnas.org\/content\/102\/3\/725.abstract\">Dupressoir\u00a0<em>et al.\u00a0<\/em>(2005)<\/a>\u00a0relatam que:<\/p>\n<blockquote>\n<p style=\"text-align: justify;\">Juntos, esses dados defendem fortemente um papel cr\u00edtico da sincicina A e B na forma\u00e7\u00e3o de sincitiotrofoblastos murinos, desfazendo assim uma situa\u00e7\u00e3o \u00fanica em que dois pares de retrov\u00edrus end\u00f3genos,\u00a0<strong>adquiridos independentemente pelas linhagens de primatas e roedores<\/strong>\u00a0, teriam sido selecionados positivamente para um papel fisiol\u00f3gico convergente.\u00a0[enfase adicionada]\n<\/blockquote>\n<p style=\"text-align: justify;\">Este \u00e9 um caso not\u00e1vel de evolu\u00e7\u00e3o convergente, de um tipo que \u00e9 altamente improv\u00e1vel que tenha ocorrido por meios darwinianos\u00b9.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify; font-size: 11px;\"><strong>Nota do tradutor \u00b9:<\/strong> Parece que o autor faz uma confus\u00e3o de ancestralidade comum com darwinismo. No caso, \u00e9 evid\u00eancia contra a ancestralidade comum, n\u00e3o contra o darwinismo, que aproveitaria o sucesso de caracter\u00edsticas, independente origem (inclusive se a origem for por edi\u00e7\u00e3o humana).<\/p>\n<p><!--\n\n# Ocultado pelo autor por parecer incompleto.\n\n\n\n<p style=\"text-align: justify;\">Mas seja como for.\u00a0<strong>Resumidamente, o argumento feito no\u00a0<a href=\"https:\/\/www.evolutionarymodel.com\/ervs.htm\">artigo citado<\/a> \u00e9 isto:<\/strong> Al\u00e9m da inser\u00e7\u00e3o de sequ\u00eancias\u00a0de ERV em <em>loci<\/em> ort\u00f3logos (e seu padr\u00e3o hier\u00e1rquico aninhado pertinente), a avalia\u00e7\u00e3o do artigo tamb\u00e9m leva em considera\u00e7\u00e3o as muta\u00e7\u00f5es compartilhadas entre ERVs ort\u00f3logos que, como n\u00f3s temos dito, tamb\u00e9m se encaixam em hierarquias aninhadas muito similares.\u00a0Como a muta\u00e7\u00e3o e a inser\u00e7\u00e3o de ERV s\u00e3o fatores independentes, argumenta-se que isso s\u00f3 faz sentido quando visto \u00e0 luz da ancestralidade comum.\u00a0Al\u00e9m disso, os graus comparativos de descontinuidade de LTR-LTR entre os ERVs ort\u00f3logos s\u00e3o considerados implicados no modelo de ancestralidade comum.\u00a0As sequ\u00eancias de repeti\u00e7\u00e3o terminal longa (LTR) devem ser id\u00eanticas na inser\u00e7\u00e3o - c\u00f3pias de promotores retrovirais s\u00e3o polimerizadas durante a transcri\u00e7\u00e3o reversa (o promotor retroviral n\u00e3o \u00e9 transcrito em mRNA, sen\u00e3o o ERV perderia o seu promotor).\u00a0Existem repeti\u00e7\u00f5es id\u00eanticas no terminal do genoma retroviral.\u00a0Durante a transcri\u00e7\u00e3o reversa, o iniciador de tRNA separa-se e a repeti\u00e7\u00e3o do DNA hibrida com a repeti\u00e7\u00e3o restante de RNA no terminal 3' do genoma. Essas repeti\u00e7\u00f5es precisam ser id\u00eanticas, caso contr\u00e1rio elas n\u00e3o podem se hibridizar.\u00a0Uma c\u00f3pia \u00fanica das se\u00e7\u00f5es 3' \u00fanicas e 5' \u00e9 polimerizada no terminal oposto.\u00a0Isso \u00e9 o que forma as repeti\u00e7\u00f5es de terminais longos (LTRs), que tamb\u00e9m devem ser id\u00eanticas <strong>no momento da integra\u00e7\u00e3o<\/strong>.\u00a0Uma vez que as LTRs s\u00e3o id\u00eanticas na transcri\u00e7\u00e3o reversa e na integra\u00e7\u00e3o, uma maior diverg\u00eancia mutacional (ancestralidade comum sendo verdadeira) deveria se correlacionar com uma inser\u00e7\u00e3o mais antiga.<\/p>\n\n --><\/p>\n<hr \/>\n<p>Original:\u00a0Jonathan M. <a href=\"https:\/\/evolutionnews.org\/2011\/05\/revisiting\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Revisiting an Old Chestnut: Retroviruses and Common Descent (Updated)<\/a>. May 25, 2011.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<div class=\"mh-excerpt\"><p>Por Jonathan M. (Adapta\u00e7\u00e3o) Um argumento comum para descend\u00eancia comum que se ouve com muita frequ\u00eancia na literatura evolucion\u00e1ria diz respeito \u00e0 inser\u00e7\u00e3o de retrov\u00edrus <a class=\"mh-excerpt-more\" href=\"https:\/\/tdibrasil.org\/index.php\/2018\/12\/10\/revisitando-uma-antiga-questao-retrovirus-e-ancestralidade-comum\/\" title=\"Revisitando uma Antiga Quest\u00e3o: Retrov\u00edrus e Ancestralidade Comum\">[&#8230;]<\/a><\/p>\n<\/div>","protected":false},"author":1,"featured_media":4858,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[25,40],"tags":[73,332,352,353,827,829],"class_list":["post-4849","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-geral","category-traducao","tag-ancestralidade-universal","tag-endogenos-retrovirus","tag-erv","tag-ervs","tag-retrovirus","tag-retrovirus-endogenos"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v18.9 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>Revisitando uma Antiga Quest\u00e3o: Retrov\u00edrus e Ancestralidade Comum &raquo; Portal TDI Brasil +<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"Por Jonathan M. 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