{"id":4791,"date":"2018-12-06T21:03:56","date_gmt":"2018-12-06T23:03:56","guid":{"rendered":"http:\/\/tdibrasil.org\/?p=4791"},"modified":"2021-10-10T03:51:16","modified_gmt":"2021-10-10T06:51:16","slug":"sobre-especies-e-software-o-que-e-um-grafico-de-dependencia","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/tdibrasil.org\/index.php\/2018\/12\/06\/sobre-especies-e-software-o-que-e-um-grafico-de-dependencia\/","title":{"rendered":"Sobre Esp\u00e9cies e Software: O Que \u00e9 um Gr\u00e1fico de Depend\u00eancia?"},"content":{"rendered":"<figure id=\"attachment_4798\" aria-describedby=\"caption-attachment-4798\" style=\"width: 580px\" class=\"wp-caption aligncenter\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-full wp-image-4798\" src=\"https:\/\/tdibrasil.org\/wp-content\/uploads\/2018\/12\/software.jpg\" alt=\"\" width=\"580\" height=\"332\" \/><figcaption id=\"caption-attachment-4798\" class=\"wp-caption-text\"><center>Os softwares s\u00e3o o que h\u00e1 de mais semelhante aos seres vivos.<\/center><\/figcaption><\/figure>\n<p style=\"text-align: justify;\">Com o desenvolvimento de tecnologias de maior n\u00edvel de engenharia o homem se viu diante da imbrica\u00e7\u00e3o de informa\u00e7\u00e3o em seus desenvolvimentos. Os sistemas de informa\u00e7\u00e3o se tornaram o cora\u00e7\u00e3o de suas cria\u00e7\u00f5es. Toda a din\u00e2mica essencialmente migrou da estrutura f\u00edsica para a informa\u00e7\u00e3o (software). Os modos de desenvolvimento para organizar essa informa\u00e7\u00e3o ficaram mais sofisticados e isso se refletiu na estrutura dos sistemas. Por isso, atrav\u00e9s da an\u00e1lise da estrutura de um sistema, \u00e9 poss\u00edvel inferir o m\u00e9todo utilizado em sua constitui\u00e7\u00e3o.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Em postagens anteriores mostramos que a l\u00f3gica das nossas \u00faltimas tecnologias come\u00e7a a se parecer cada vez mais com as formas do Sistema Natural (seres vivos e suas rela\u00e7\u00f5es), o resultado \u00e9 surpreendentemente positivo em compara\u00e7\u00e3o, o que justifica a infer\u00eancia ao design na hist\u00f3ria de cria\u00e7\u00e3o dos organismos biol\u00f3gicos.<\/p>\n<hr \/>\n<p>Por <strong>Cornelius Hunter<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Um\u00a0<a href=\"https:\/\/bio-complexity.org\/ojs\/index.php\/main\/article\/view\/BIO-C.2018.3\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">artigo recente\u00a0<\/a>na revista\u00a0<i>BIO-Complexity<\/i>, de autoria de Winston Ewert, usa uma abordagem de <strong>gr\u00e1fico de depend\u00eancia<\/strong> para modelar as rela\u00e7\u00f5es entre as esp\u00e9cies.\u00a0Essa ideia \u00e9 inspirada na ci\u00eancia da computa\u00e7\u00e3o, que faz grande uso de gr\u00e1ficos de depend\u00eancia para empacotamento de software e otimiza\u00e7\u00e3o da arquitetura de software.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Aplicativos de software complicados geralmente usam uma grande variedade de rotinas de software de baixo n\u00edvel.\u00a0Essas rotinas foram desenvolvidas, testadas e armazenadas em m\u00f3dulos para uso por aplicativos de alto n\u00edvel.\u00a0Quando isso acontece, o aplicativo herda o software de n\u00edvel inferior e tem depend\u00eancia desses<span class=\"Apple-converted-space\">\u00a0<\/span>m\u00f3dulos.<\/p>\n<p><strong>Um diagrama de design<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Tais aplicativos s\u00e3o escritos em linguagens leg\u00edveis por humanos, como Java.\u00a0Eles ent\u00e3o precisam ser traduzidos para linguagem de m\u00e1quina.\u00a0A ferramenta de compila\u00e7\u00e3o executa a convers\u00e3o e a ferramenta de compila\u00e7\u00e3o monta o resultado, juntamente com as rotinas de n\u00edvel inferior, em um programa execut\u00e1vel.\u00a0Essas ferramentas usam gr\u00e1ficos de depend\u00eancia para modelar o software, essencialmente criando um diagrama de projeto ou um <em>blueprint<\/em> que mostra as depend\u00eancias, especificando os diferentes m\u00f3dulos de software que ser\u00e3o necess\u00e1rios e como eles est\u00e3o conectados juntos.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Os gr\u00e1ficos de depend\u00eancia tamb\u00e9m ajudam no design de software.\u00a0Como eles fornecem um modelo da arquitetura de software, eles s\u00e3o \u00fateis para projetar arquiteturas desacopladas e promover a reutiliza\u00e7\u00e3o de software.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Os gr\u00e1ficos de depend\u00eancia tamb\u00e9m s\u00e3o usados \u200b\u200bpelas chamadas equipes de &#8220;DevOps&#8221; para auxiliar no tempo de implanta\u00e7\u00e3o no sequenciamento e na instala\u00e7\u00e3o dos m\u00f3dulos corretos para aplicativos corporativos.<\/p>\n<p><strong>Um modelo falhado<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">O que Ewert desenvolveu \u00e9 um\u00a0<a href=\"https:\/\/tdibrasil.org\/index.php\/2018\/08\/15\/bio-complexity-apresenta-o-melhor-modelo-para-explicar-o-padrao-da-vida\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">modelo para explicar o padr\u00e3o de similaridades<\/a>\u00a0em diferentes organismos que imita como as aplica\u00e7\u00f5es de computador herdam o software de uma gama diversificada de m\u00f3dulos de n\u00edvel inferior.\u00a0Esp\u00e9cies parecem tamb\u00e9m usar m\u00f3dulos de n\u00edvel mais baixo que executam uma gama diversificada de aplica\u00e7\u00f5es biol\u00f3gicas.\u00a0Ewert estudou especificamente como os genomas incorporam v\u00e1rias fam\u00edlias de genes que se agrupam em uma ampla gama de m\u00f3dulos gen\u00e9ticos e como os m\u00f3dulos gen\u00e9ticos alimentam uma gama diversa de genomas.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Superficialmente, \u00e0 dist\u00e2ncia, o padr\u00e3o de uso do m\u00f3dulo pode parecer similar \u00e0 <strong>\u00e1rvore evolucion\u00e1ria tradicional<\/strong>.\u00a0Mas esse modelo <strong>falhou repetidamente<\/strong> \u00e0 medida que os cientistas estudavam os caracteres das esp\u00e9cies mais de perto.\u00a0A pesquisa inicial de Ewert sugere que os <strong>gr\u00e1ficos de depend\u00eancia<\/strong>, por outro lado, poderiam fornecer um <strong>modelo muito superior<\/strong>\u00b9 das rela\u00e7\u00f5es entre as esp\u00e9cies e seu fluxo de informa\u00e7\u00f5es gen\u00e9ticas.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify; font-size: 11px;\"><strong>Nota do tradutor \u00b9:<\/strong> Desconfio muito sobre ser &#8220;muito superior&#8221; ao modelo de \u00e1rvore. Penso que os dois modelos tenham que ser combinados para que se satisfa\u00e7a a melhor explica\u00e7\u00e3o. Em todo caso, como vimos no <a href=\"https:\/\/tdibrasil.org\/index.php\/2018\/12\/03\/proposta-de-grafico-de-dependencia-de-ewert-uma-floresta-de-composicoes\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">\u00faltimo texto<\/a>, a configura\u00e7\u00e3o dos genomas, seja por depend\u00eancia ou heran\u00e7a (\u00e1rvore), favorecem a infer\u00eancia ao design. Uma \u00e1rvore evolutiva deveria apresentar ainda uma outra configura\u00e7\u00e3o.<\/p>\n<hr \/>\n<p>Original:\u00a0<strong>Cornelius Hunter.<\/strong> <a href=\"https:\/\/evolutionnews.org\/2018\/08\/of-species-and-software-what-is-a-dependency-graph\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Of Species and Software: What Is a Dependency Graph?<\/a> August 3, 2018.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<div class=\"mh-excerpt\"><p>Com o desenvolvimento de tecnologias de maior n\u00edvel de engenharia o homem se viu diante da imbrica\u00e7\u00e3o de informa\u00e7\u00e3o em seus desenvolvimentos. 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