{"id":114,"date":"2015-11-27T13:30:12","date_gmt":"2015-11-27T15:30:12","guid":{"rendered":"http:\/\/tdibrasil.org\/?p=114"},"modified":"2021-10-10T03:52:47","modified_gmt":"2021-10-10T06:52:47","slug":"projeto-encode-vs-darwinismo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/tdibrasil.org\/index.php\/2015\/11\/27\/projeto-encode-vs-darwinismo\/","title":{"rendered":"Porque os darwinistas est\u00e3o furiosos com o projeto ENCODE? Livnat explica"},"content":{"rendered":"<p>&nbsp;<\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"aligncenter\" src=\"https:\/\/tdibrasil.org\/wp\/Selecao%20natural%20e%20ENCODE.png\" alt=\"\" width=\"500\" height=\"300\" \/><\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Uma das maiores ambi\u00e7\u00f5es do mundo cient\u00edfico \u00e9 compreender o genoma humano (DNA) em sua totalidade, e um dos maiores passos nesse sentido foi o Projeto Genoma Humano, iniciado em 1988 <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[1]<\/span>. Dada a complexidade do nosso DNA (e gra\u00e7as \u00e0 tecnologia menos avan\u00e7ada usada durante o processo), o primeiro esbo\u00e7o do genoma inteiro s\u00f3 veio a ser divulgado em 2000, levando mais 3 anos para a divulga\u00e7\u00e3o de sua forma definitiva <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[1]<\/span>.<!--more--><\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Apesar de o genoma ter sido completamente mapeado, logo ficou claro que os cientistas n\u00e3o chegaram nem perto de atingir seu objetivo final. Dos mais de 3.2 bilh\u00f5es de bases pareadas do nosso DNA, menos de 2% representa a regi\u00e3o respons\u00e1vel por codificar prote\u00ednas (isto \u00e9, que possuem \u201cinstru\u00e7\u00f5es\u201d sobre como \u201cmont\u00e1-las\u201d) <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[2]<\/span>. Ou seja, ~98% do DNA se mostrou um completo mist\u00e9rio e, gra\u00e7as ao pensamento darwinista, essa vasta regi\u00e3o foi e ainda \u00e9 rotulada como &#8220;junk DNA&#8221; (DNA lixo), mera &#8220;sucata&#8221; acumulada durante bilh\u00f5es de anos de hist\u00f3ria e &#8220;experimentos&#8221; evolutivos.<span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[3]<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">A fim de elucidar a fun\u00e7\u00e3o dessa regi\u00e3o, surgiu o projeto internacional <strong>ENCODE<\/strong> (Enciclop\u00e9dia de Elementos do DNA) em 2003, contando com a participa\u00e7\u00e3o de 27 institutos <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[4]<\/span>. Em 2012, veio a bomba: em um artigo assinado por todos os l\u00edderes do projeto, divulgou-se que ao menos 80.4% do genoma humano \u00e9 ativo, funcional <span style=\"color: #0000ff;\"><span style=\"text-decoration: underline;\">[5]<\/span>\u00a0<span style=\"text-decoration: underline;\">[6]<\/span><\/span>!<\/p>\n<figure id=\"attachment_2455\" aria-describedby=\"caption-attachment-2455\" style=\"width: 440px\" class=\"wp-caption aligncenter\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"wp-image-2455 \" src=\"https:\/\/tdibrasil.org\/wp-content\/uploads\/2015\/11\/ENCODE-300x214.jpg\" width=\"440\" height=\"313\" \/><figcaption id=\"caption-attachment-2455\" class=\"wp-caption-text\"><center>Logo do Projeto ENCODE<\/center><\/figcaption><\/figure>\n<p style=\"text-align: left;\">Eu uso o termo \u201cbomba\u201d porque essa not\u00edcia rapidamente se tornou o estopim de uma verdadeira controv\u00e9rsia acad\u00eamica, justamente por ter instigado a ira de um certo grupo\u2026 Sim, \u00e9 claro que estou me referindo aos bi\u00f3logos evolutivos, que logo publicaram cr\u00edticas exasperadas contra o projeto ENCODE (contra o percentual citado acima e contra a afirma\u00e7\u00e3o de que \u201c<em>todos os livros did\u00e1ticos est\u00e3o errados<\/em>\u201d <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[6]<\/span>, feita por um dos l\u00edderes do ENCODE), a exemplo de Dan Graur <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[6]<\/span> e W. F. Doolitler <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[7]<\/span>, entre outros.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Aparentemente, o embate \u00e9 motivado pela defini\u00e7\u00e3o de \u201cfun\u00e7\u00e3o\u201d usada pela equipe do ENCODE (para eles, funcionalidade \u00e9 atribu\u00edda a segmentos no genoma que codificam um produto definido (e.g. prote\u00edna ou RNA n\u00e3o-codificante (ncRNA)) ou demonstram uma assinatura bioqu\u00edmica (segmentos onde prote\u00ednas se ligam; encontrados em regi\u00f5es de cromatina aberta; localizados em regi\u00f5es contendo acentuassomos (enhancers); segmentos que contenham uma regi\u00e3o CpG metilada ou que sejam associados a histonas <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[5, 6]<\/span>). Para Graur e colegas darwinistas, \u201cfun\u00e7\u00e3o\u201d significa uma regi\u00e3o \u201cconservada\u201d pela sele\u00e7\u00e3o \u201cpurificadora\u201d que n\u00e3o pode ser sujeita a muta\u00e7\u00f5es delet\u00e9rias <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[6]<\/span>, encontrada em duas ou mais esp\u00e9cies pr\u00f3ximas <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[8]<\/span>.<\/p>\n<figure style=\"width: 500px\" class=\"wp-caption aligncenter\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" src=\"https:\/\/www.encodeproject.org\/images\/c45f4d8c-0340-4fcb-abe3-e4ff0bb919be\/@@download\/attachment\/EncodeDatatypes2013-7.png\" width=\"500\" height=\"300\" \/><figcaption class=\"wp-caption-text\"><center>Uma das ilustra\u00e7\u00f5es demonstrando resultados dos estudos do ENCODE [Fonte: https:\/\/www.encodeproject.org\/]<\/center><\/figcaption><\/figure>\n<p style=\"text-align: left;\">Todavia, como podemos ler nas palavras de Adi Livnat (primeira imagem), a disputa contra os 80% \u00e9 claramente causada por sua incompatibilidade com o paradigma darwinista tradicional que impera desde os anos 1930 (data de origem da s\u00edntese moderna), que defende que muta\u00e7\u00f5es ben\u00e9ficas que se acumulariam ao ponto de gerarem alguma fun\u00e7\u00e3o (e.g. um gene que produza uma prote\u00edna respons\u00e1vel por um fen\u00f3tipo) seriam conservadas pela sele\u00e7\u00e3o natural. Mas, para gerar um s\u00f3 gene operante, muitas tentativas falhas ocorreriam, gerando um monte de sucata acumulada.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Isso \u00e9 evid\u00eancia incontest\u00e1vel de que\u00a0o apego dos darwinistas ao paradigma supera at\u00e9 mesmo a sede e compromisso\u00a0com o\u00a0progresso cient\u00edfico\u2026 E n\u00e3o estou exagerando\u00a0aqui, o pr\u00f3prio\u00a0Doolittle \u00a0deixa isso claro:<\/p>\n<blockquote>\n<p style=\"text-align: left;\"><span style=\"color: #000000;\">&#8216;Eu sugerirei que n\u00f3s, como bi\u00f3logos, defendamos a concep\u00e7\u00e3o tradicional de fun\u00e7\u00e3o: a publicidade ao redor do ENCODE revela a extens\u00e3o do quanto essa concep\u00e7\u00e3o tem erodido&#8217; <span style=\"color: #0000ff;\"><em><span style=\"text-decoration: underline;\">[7]<\/span><\/em><\/span><\/span><\/p>\n<\/blockquote>\n<p>Assim como\u00a0Graur, que atesta que o ENCODE n\u00e3o oferece raz\u00f5es suficientes para:<\/p>\n<blockquote>\n<p style=\"text-align: left;\"><span style=\"color: #000000;\">&#8216;Abandonar a concep\u00e7\u00e3o prevalente entre os bi\u00f3logos evolutivos segundo a qual muito do genoma humano \u00e9 desprovido de fun\u00e7\u00e3o&#8217; <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[6]<\/span><\/span><\/p>\n<\/blockquote>\n<p style=\"text-align: left;\"><span style=\"color: #000000;\">Seguindo o pensamento darwinista \u00e0 risca, eles chegam a predizer\u00a0que a maior parte do junk DNA nunca sequer ir\u00e1 adquirir fun\u00e7\u00e3o alguma <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[9]<\/span> ! Imaginem o que seria da ci\u00eancia se toda a comunidade levasse essa suposi\u00e7\u00e3o darwinista a s\u00e9rio\u2026 Simplesmente todas as pesquisas deveriam ser\u00a0abandonadas, afinal, de que\u00a0adianta pesquisar sucata in\u00fatil e descart\u00e1vel? Isso seria uma trag\u00e9dia, principalmente para a medicina, impedindo inclusive a compreens\u00e3o da causa de doen\u00e7as como c\u00e2ncer, e a descoberta de tratamentos eficazes contra as mesmas&#8230; Mas, para nossa sorte, os\u00a0pesquisadores biom\u00e9dicos, entre outros, t\u00eam celebrado grandemente o projeto ENCODE, reconhecendo seu benef\u00edcio potencial para o avan\u00e7o das \u00e1reas da sa\u00fade. Marco Galasso et al. , por exemplo, descrevem bem a import\u00e2ncia do estudo dos ncRNAs:<\/span><\/p>\n<blockquote>\n<p style=\"text-align: left;\"><span style=\"color: #000000;\">&#8216;Nos \u00faltimos anos se tornou claro que os ncRNAs est\u00e3o envolvidos em muitos processos fisiol\u00f3gicos e contribuem na altera\u00e7\u00e3o molecular em casos patol\u00f3gicos. In\u00fameras classes de ncRNAs, como o siRNA, microRNA, piRNA, snRNA e regi\u00f5es transcritas ultra-conservadas t\u00eam participa\u00e7\u00e3o em casos de c\u00e2ncer, doen\u00e7as card\u00edacas, desordens auto-imunes, metab\u00f3licas e neurodegenerativas. NcRNAs possuem papel fundamental na regula\u00e7\u00e3o gen\u00e9tica [\u2026]&#8217; <span style=\"color: #0000ff;\"><em><span style=\"text-decoration: underline;\">[10]<\/span><\/em><\/span><\/span><\/p>\n<\/blockquote>\n<p><span style=\"color: #000000;\">Em harmonia com o que \u00e9 defendido pelos proponentes do Design Inteligente, Bhatia e Kleinjan <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[11]<\/span> relatam:<\/span><\/p>\n<blockquote>\n<p style=\"text-align: left;\"><span style=\"color: #000000;\">&#8216;O CONTROLE PRECISO da express\u00e3o de PROGRAMAS gen\u00e9ticos \u00e9 crucial para o estabelecimento de diversos padr\u00f5es de atividades g\u00eanicas necess\u00e1rias para o desenvolvimento, modelagem e diferencia\u00e7\u00e3o de milhares de tipos de c\u00e9lulas de um organismo. A import\u00e2ncia crucial das regi\u00f5es n\u00e3o-codificantes \u00e9 um fato bem estabelecido e depende de diversos grupos de fragmentos chamados de elementos cis-regulat\u00f3rios [\u2026] Maior entendimento sobre o controle da express\u00e3o dos genes \u00e9 de suma import\u00e2ncia para a sa\u00fade humana, visto que defeitos nessa regula\u00e7\u00e3o s\u00e3o uma sabida causa significante de enfermidades.&#8217; <em>(\u00eanfase minha)<\/em><\/span><\/p>\n<\/blockquote>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<figure style=\"width: 500px\" class=\"wp-caption aligncenter\"><a href=\"https:\/\/ruo.mbl.co.jp\/bio\/g\/product\/epigenetics\/images\/RNAworld\/Table.jpg\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" src=\"https:\/\/ruo.mbl.co.jp\/bio\/g\/product\/epigenetics\/images\/RNAworld\/Table.jpg\" width=\"500\" height=\"353\" \/><\/a><figcaption class=\"wp-caption-text\"><center>Lista b\u00e1sica com alguns ncRNAs, comprimento, em quais dom\u00ednios s\u00e3o encontrados e suas respectivas fun\u00e7\u00f5es.<\/center><\/figcaption><\/figure>\n<p style=\"text-align: left;\">Os diversos danos que a evolu\u00e7\u00e3o vem causando \u00e0 ci\u00eancia s\u00e3o algumas das maiores raz\u00f5es pelas quais nos manifestamos contra essa equivocada \u201cteoria\u201d. Os erros induzidos pelo darwinismo no passado (como \u00e9 o caso das fraudes de Haeckel e o homem de Piltdown, etc; conceitos nocivos (e.g. \u00f3rg\u00e3os \u201cvestigiais\u201d, eugenia e darwinismo social) e equ\u00edvocos cient\u00edficos (junk DNA)) s\u00e3o at\u00e9 perdo\u00e1veis; no entanto,\u00a0\u00e9 inadmiss\u00edvel que darwinistas prossigam prejudicando a ci\u00eancia em prol da manuten\u00e7\u00e3o dessa s\u00edntese falha e arcaica, tudo isso por obstina\u00e7\u00e3o e intriga contra o movimento do design inteligente, como apontado por J. Mattick e Dinger <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[3]<\/span>:<\/p>\n<blockquote>\n<p style=\"text-align: left;\"><span style=\"color: #000000;\">&#8216;Finalmente, sugerimos que a resist\u00eancia contra os resultados do ENCODE \u00e9 motivada tamb\u00e9m, em certos casos, pelo uso do conceito d\u00fabio do junk DNA como evid\u00eancia contra o design inteligente&#8217;.<\/span><\/p>\n<\/blockquote>\n<p style=\"text-align: left;\"><span style=\"color: #000000;\">E o furor dos darwinistas contra o ENCODE continua, inclusive nas redes sociais <span style=\"text-decoration: underline; color: #0000ff;\">[12]<\/span>, mas nada que fizerem ir\u00e1 impedir essa nova tend\u00eancia\u00a0protagonizada por esse e outros projetos paralelos, e m\u00faltiplos estudos continuar\u00e3o revelando as fun\u00e7\u00f5es cruciais dessas\u00a0dezenas de ncRNAs para a estabilidade do genoma e sua regula\u00e7\u00e3o. Essa verdadeira revolu\u00e7\u00e3o nas \u00e1reas biol\u00f3gicas\u00a0tem,\u00a0inclusive, levado defensores da evolu\u00e7\u00e3o, incluindo o pr\u00f3prio Adi Livnat, a criticarem ferrenhamente a s\u00edntese moderna, pedindo por reformas, ou mesmo completa substitui\u00e7\u00e3o dela.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">E, como sempre, o avan\u00e7o dessas pesquisas (e da ci\u00eancia em geral) somente refor\u00e7ar\u00e1 ainda mais a Teoria do Design Inteligente como o paradigma correto e mais harm\u00f4nico com os fatos.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">\n<hr \/>\n<h2 style=\"text-align: left;\">Refer\u00eancias<\/h2>\n[1] <strong>The Human Genome Project Completion: Frequently Asked Questions<\/strong>. &lt;https:\/\/www.genome.gov\/11006943&gt;<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[2] Cory McLean and Gill Bejerano. <strong>Dispensability of mammalian DNA.<\/strong> Genome Res. Oct 2, 2008; doi: 10.1101\/gr.080184.108<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[3] J S Mattick, M E Dinger. <strong>The extent of functionality in the human genome.<\/strong> The HUGO Journal 2013, 7:2 doi:10.1186\/1877-6566-7-2<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[4] The ENCODE Project Consortium (2011) <strong>A User\u2019s Guide to the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE)<\/strong>. PLoS Biol 9(4): e1001046. doi:10.1371\/<br \/>\njournal.pbio.1001046<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[5] The ENCODE Project Consortium (2012) <strong>An integrated encyclopedia of DNA\u00a0elements in the human genome.<\/strong> Nature. 2012 Sep 6;489(7414):57-74 doi:10.1038\/nature11247<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[6] Dan Graur, Yichen Zheng, Nicholas Price, Ricardo B.R. Azevedo, Rebecca A. Zufall, and Eran Elhaik (2013). <strong>On the Immortality of Television Sets: \u201cFunction\u201d in the Human Genome According to the Evolution-Free Gospel of ENCODE<\/strong>. Genome Biol. Evol.5 (3):578\u2013590. doi:10.1093\/gbe\/evt028<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[7] W. Ford Doolittle (2012)<strong> Is junk DNA bunk? A critique of ENCODE.<\/strong> PNAS April 2, 2013 vol. 110 no. 14 5294-5300 doi: 10.1073\/pnas.1221376110<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[8] Manolis Kellis et al. <strong>Defining functional DNA elements in the human genome<\/strong>. PNAS April 29, 2014 vol. 111 no. 17 6131-6138 doi:10.1073\/pnas.1318948111<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[9] Garrido-Ramos (2015) <strong>Satellite DNA in Plants: More than Just Rubbish<\/strong>. Cytogenet Genome Res 2015;146:153-170 (DOI:10.1159\/000437008)<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[10] Marco Galasso, Maria Elena Sana and Stefano Volinia (2010) <strong>Non-coding RNAs: a key to future personalized molecular therapy?<\/strong> Genome Medicine 2010, 2:12 doi:10.1186\/gm133<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[11] Shipra Bhatia, Dirk A. Kleinjan. (2014) <strong>Disruption of long\u2011range gene regulation in human genetic disease: a kaleidoscope of general principles, diverse mechanisms and unique phenotypic consequences<\/strong>. Hum Genet DOI 10.1007\/s00439-014-1424-6. Springer<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">[12] Chris Woolston. <strong>Furore over genome function<\/strong>. Nature 512, 9 (07 August 2014) doi:10.1038\/512009e Published online 06 August 2014<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<div class=\"mh-excerpt\"><p>&nbsp; Uma das maiores ambi\u00e7\u00f5es do mundo cient\u00edfico \u00e9 compreender o genoma humano (DNA) em sua totalidade, e um dos maiores passos nesse sentido foi <a class=\"mh-excerpt-more\" href=\"https:\/\/tdibrasil.org\/index.php\/2015\/11\/27\/projeto-encode-vs-darwinismo\/\" title=\"Porque os darwinistas est\u00e3o furiosos com o projeto ENCODE? 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